Năm 2016, Bộ GD&ĐT từng yêu cầu Đại học Kinh doanh và Công nghệ Hà Nội trả hồ sơ cho thí sinh trúng tuyển ngành Y đa khoa do chưa được phép tuyển sinh ngành này ở trường.
Năm 2017, 1 nam sinh Hà Nội dù đạt 29,25 điểm nhưng vẫn không thể nào đỗ vào Đại học Y Hà Nội, trong khi điểm chuẩn cao nhất của trường này năm 2018 chỉ là 24,75 điểm của ngành Y đa khoa!