Đơn nguyên 1A diện tích 17.316 m2, gồm khoa khám bệnh; các khu cấp cứu, nghiệp vụ kỹ thuật và cận lâm sàng; hành chính. Đơn nguyên 1B diện tích 11.797 m2, chức năng điều trị nội trú và dịch vụ tích hợp.
Dự án tổng mức đầu tư gần 785 tỷ đồng, khởi công đầu năm 2023. Về quy mô giường bệnh, cơ sở có 24 khoa phòng, quy mô 200 giường nội trú, về lâu dài tổng công suất phục vụ sẽ là 500 giường nội trú.
Khi vào hoạt động chính thức, dự kiến mỗi ngày Bệnh viện Nhi Hà Nội khám chữa ngoại trú cho gần 1.000 bệnh nhân và điều trị nội trú cho 200 trẻ. Bệnh nhân đến khám sẽ đăng ký tự động qua nhận diện khuôn mặt và được hướng dẫn đi vào khu khám bệnh. Cơ sở này cũng phát triển những dịch vụ đặt lịch hẹn khám qua website, fanpage và ứng dụng, để tăng sự thuận tiện.