Ngay khi vừa lên sóng, các diễn viên đảm nhận vai chính như Việt Anh, Huỳnh Anh, Lương Thanh… nhận vô số lời chê bai, chỉ trích của khán giả. Trong khi đó, dàn nhân vật phụ lại được nhận xét diễn xuất bùng nổ và để lại ấn tượng mạnh với người xem.
Tình huống nhân vật Điều - trùm cuối của thứ nước khoái – biệt dược gây ra cái chết cho nhiều nạn nhân bị trừ khử trong tập cuối Biệt Dược Đen bị nhận xét thiếu kịch tính, quá đơn giản để khép lại vụ án.
Những diễn biến cuối phim Biệt Dược Đen được đạo diễn khẳng định có nhiều cú ngoặt, tình huống hấp dẫn, kịch tính. Phân đoạn quan trọng mang tính bước ngoặt ở cuối phim được quay trong đêm khuya, tại khu vực bãi giữa sông Hồng (Hà Nội).