Theo báo cáo của Cục Quản lý đê điều và Phòng, chống thiên tai (Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn), tính đến 18h ngày 9/9, có 71 người chết và mất tích (49 người chết, 22 người mất tích) do bão Yagi, sạt lở đất, lũ quét và lũ cuốn.
Trong đó, thời điểm xảy ra bão Yagi khiến 12 người, còn sạt lở đất, lũ quét có 53 người và 6 người do lũ cuốn.
Cơ quan chức năng cũng có thống kê con số cụ thể tại từng địa phương: Cao Bằng 8 người chết, 13 người mất tích; Lào Cai 18 người chết, 6 người mất tích; Quảng Ninh 9 người chết; Hải Phòng 2 người chết; Hải Dương 1 người chết; Hà Nội 1 người chết; Hòa Bình 4 người; Yên Bái 3 người chết; Lạng Sơn 2 người chết; Bắc Giang 1 người mất tích do lũ cuốn; Tuyên Quang 2 người mất tích; Hà Giang 1 người chết.
Chiều 9/9, Trung tâm Dự báo khí tượng thuỷ văn quốc gia cho biết, trong 12 giờ qua, lũ trên sông Thao (Lào Cai, Yên Bái, Phú Thọ), sông Lô (Hà Giang, Tuyên Quang), sông Cầu (Bắc Ninh) và sông Thương (Bắc Giang), sông Thái Bình (Hải Dương), sông Hồng (Hà Nội) đang lên.
Sông Lục Nam (Bắc Giang) tại trạm Lục Nam đã đạt đỉnh ở mức 6,72 m lúc 10h ngày 9/9, trên báo động (BĐ) 3 0,42m và đang xuống chậm. Sông Hoàng Long (Ninh Bình) đang tiếp tục xuống.
Mực nước lúc 13h ngày 9/9 trên sông Thao tại Yên Bái 33,98m, trên báo động (BĐ) 3 là 1,98m; trên sông Cầu tại Đáp Cầu 5,18m, dưới BĐ2 là 0,12m; sông Thương tại Phủ Lạng Thương 5,82m, trên BĐ2 là 0,52m; sông Lục Nam tại Lục Nam 6,67m, trên BĐ3 là 0,37m; sông Hoàng Long tại Bến Đế 3,27m, dưới BĐ2 là 0,23m; sông Lô tại Tuyên Quang 21,82m, dưới BĐ1 là 0,18m; sông Thái Bình tại Phả Lại 4,12m, trên BĐ1 là 0,12m; sông Hồng tại Hà Nội 6,76m, dưới BĐ1 là 2,74m.
Dự báo trong 6 - 12 giờ tới, lũ trên sông Lục Nam tiếp tục xuống dưới BĐ3. Trong khi đó, lũ trên sông Lô tại Tuyên Quang tiếp tục lên nhanh trên mức BĐ1. Lũ trên sông Thao tại Lào Cai, Yên Bái tiếp tục và duy trì trên mức BĐ3 (lũ tại Yên Bái tương đương năm 2008).
Trong 12 - 24 giờ tiếp theo, lũ trên sông Lục Nam sẽ xuống mức BĐ2; lũ trên sông Lô tại Tuyên Quang tiếp tục lên nhanh vượt mức BĐ2 vào sáng 10/9.
Trên sông Thao tại Lào Cai, Yên Bái, lũ sẽ biến đổi chậm, duy trì ở mức trên BĐ3. Lũ trên sông Thao tại Phú Thọ tiếp tục lên vượt mức BĐ1. Trên sông Cầu, sông Thương lũ tiếp tục lên mức BĐ3 và sông Thái Bình tiếp tục lên trên mức BĐ2. Lũ trên sông Hồng tại Hà Nội tiếp tục lên nhanh ở mức BĐ1 vào đêm 10/9.
Cơ quan khí tượng cảnh báo, từ nay đến 11/9, trên các sông khác ở Bắc Bộ xuất hiện 1 đợt lũ. Trong đợt lũ này, đỉnh lũ trên các sông nhỏ tại các tỉnh miền núi phía Bắc, đặc biệt tại các tỉnh Lạng Sơn, Cao Bằng, Bắc Kạn, Bắc Giang, Lào Cai, Yên Bái, Hòa Bình, Sơn La lên mức BĐ2-BĐ3, có sông trên BĐ3.
Do lũ trên các sông miền Bắc lớn nên nguy cơ cao xảy ra ngập lụt tại các vùng trũng thấp ven sông tại các tỉnh Lạng Sơn, Cao Bằng, Lào Cai, Yên Bái, Phú Thọ, Bắc Giang, Bắc Kạn, Thái Nguyên, Hòa Bình, Ninh Bình, Thanh Hóa; lũ quét và sạt lở đất trên các sườn dốc ở khu vực vùng núi Bắc Bộ, Thanh Hóa.