Tuy nhiên, trong quá trình tham gia xét tuyển chung, Học viện Biên phòng và Trường Sĩ quan Pháo binh đã để xảy ra sai sót kỹ thuật, dẫn tới một số thí sinh không trúng tuyển nguyện vọng 1 vào hai trường nhưng chưa có tên trong danh sách trúng tuyển các nguyện vọng kế tiếp thí sinh đã đăng ký.
Sau khi nhận được báo cáo của hai trường, để kịp thời khắc phục sai sót, ngày 10/8, Ban Tuyển sinh quân sự Bộ Quốc phòng đã có văn bản đề nghị Bộ Giáo dục và Đào tạo rà soát kết quả trúng tuyển các nguyện vọng kế tiếp và sớm công bố kết quả xét tuyển để đảm bảo quyền lợi cho thí sinh.