Chiều tối 6/9, Ủy ban Quốc gia ứng phó sự cố, thiên tai và tìm kiếm cứu nạn cho biết, thực hiện Công điện của Thủ tướng Chính phủ và Công điện của Bộ Tổng Tham mưu Quân đội nhân dân Việt Nam về việc ứng phó với bão số 3 , Ủy ban tiếp tục đôn đốc cơ quan, bộ ngành, địa phương và các đơn vị quân đội duy trì nghiêm chế độ trực.
Bộ Tổng tham mưu yêu cầu các đơn vị nắm chắc tình hình diễn biến và hướng di chuyển của bão, sẵn sàng lực lượng, phương tiện ứng phó kịp thời, hiệu quả các tình huống sự cố, thiên tai, tìm kiếm cứu nạn .
Cùng đó, Bộ Tổng tham mưu cử cán bộ tham gia 2 đoàn công tác của Chính phủ, thành lập 1 đoàn công tác kiểm tra công tác phòng, chống bão tại Quảng Ninh, Hải Phòng, Thái Bình và Nam Định.
Bộ Tư lệnh Bộ đội Biên phòng chỉ đạo Bộ đội Biên phòng các tỉnh phối hợp với chính quyền địa phương, Bộ Chỉ huy quân sự các tỉnh, thành phố ven biển từ Quảng Ninh đến Phú Yên tích cực, chủ động triển khai công tác ứng phó bão YAGI.
Đến nay, các đơn vị quân đội tiếp tục tổ chức bắn pháo hiệu tại 22 điểm; thông báo, kiểm đếm, hướng dẫn trên 51.300 phương tiện và hơn 219.900 người biết diễn biến, hướng đi của bão để ngư dân chủ động di chuyển vòng tránh, thoát khỏi khu vực nguy hiểm.
Đến 13h ngày 6/9, 100% các tàu, phương tiện từ Quảng Ninh đến Quảng Trị đã được neo đậu tại bến và tổ chức kiểm soát chặt chẽ theo lệnh cấm biển của các địa phương.
Lực lượng Quân đội cũng phối hợp với lực lượng chức năng hướng dẫn, hỗ trợ khách du lịch trên các đảo vào đất liền (hoặc vào khu vực nhà kiên cố, bảo đảm an toàn trên các đảo) trước 12 giờ ngày 6/9.
Lực lượng chức năng kiên quyết kêu gọi ngư dân, người trên các lồng bè nuôi trồng thủy sản lên bờ trước 18 giờ ngày 6/9. Các tỉnh ven biển từ Quảng Ninh đến Ninh Bình có hơn 7.120 lồng bè, chòi canh với gần 7.000 lao động đã được các đơn vị Quân đội phối hợp với địa phương hỗ trợ chằng chống, di chuyển đến vị trí tránh bão.
Cán bộ, chiến sĩ Biên phòng, cùng các lực lượng tuyên truyền, vận động, yêu cầu lao động lên bờ để bảo đảm an toàn trước khi bão đổ bộ vào bờ.