Những cơn mưa lớn đầu mùa ở TP. HCM khiến nước tràn xuống cống rãnh kênh Nhiêu Lộc Thị Nghè làm ô nhiễm cục bộ gây nên tình trạng cá chết hàng loạt. Ghi nhận tại dòng kênh mặt nước đen ngòm, bốc mùi hôi thối, cá chết trắng nổi lềnh bềnh trên mặt nước dọc 2 bờ kênh Nhiêu Lộc – Thị Nghè lẫn với đủ loại rác thải (nhiều nhất từ cầu Kiệu đến cầu Lê Văn Sỹ đường Hoàng Sa - quận 3 - TP. HCM).
Nguyên nhân được xác định là do mưa đầu mùa với lưu lượng lớn tràn xuống kênh, cộng với nguồn nước bị ô nhiễm.Nhiều người dân sống tại khu vực cho biết: “Tình trạng cá chết đã xảy ra
từ mấy ngày nay mà vẫn chưa hết, dòng nước đen ngòm bốc mùi hôi thối cũng
gây ảnh hưởng đến đời sống của nhiều người dân hai bên bờ kênh".
Rác thải và cá chết trôi dọc trên dòng kênh.Ông Trần Văn Sơn - Phó Chi cục trưởng, Chi cục quản lí chất lượng và bảo vệ nguồn lợi thủy sản TP. HCM (Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn TP. HCM), cho biết: “Tình trạng cá chết xảy ra trên kênh Nhiêu Lộc - Thị Nghè là do những đợt mưa lớn đầu mùa, nước tràn xuống dòng kênh làm ô nhiễm cục bộ nguồn nước. Sau khi tiếp nhận thông tin, chúng tôi đã cho người đi kiểm tra các hồ bơm, thiết bị lọc nước trên đầu nguồn để đảm bảo nguồn nước sạch giảm khí độc để trả lại nguồn nước trong sạch cho đàn cá sinh sống”.
Ngoài ra, nguồn rác thải sinh hoạt của người dân đổ xuống kênh cũng là nguyên nhân khiến nguồn nước bị ô nhiễm và cá chết.